日本。在伊豆海岸航行的一艘赌船上，铁龙会会长遭到年轻保镖石川五右卫门的袭击，石川五右卫门救了他。然而，紧接着发生了巨大的爆炸，船被毁了。老板也失去了生命。爆炸的起因是一名使用斧头作为武器的大汉。五右卫门曾一度将这名男子逼入绝境，但他成功逃脱。与此同时，成功从赌船上偷钱的鲁邦三世、次元大辅和峰不二子在海上的船上目睹了这一事件。《百慕大之魂》——这就是所谓的大人物。一名代号为霍克的士兵，曾在战场上杀死了2000人。为什么日本的公安督察钱形会追随霍克的脚步？在老板的葬礼上被贴上叛徒标签的五右卫门追赶霍克以报耻辱。

石川五右卫门是活跃在安土桃山时代的日本劫富济贫的大盗，专门和丰臣秀吉对着干。由于是以石川五右卫门为正面角色进行戏说演绎，本剧将丰臣秀吉设定为了实施暴政的反派boss并对历史做出了一定修改

神秘绝症赤面疱疮的出现，彻底改变德川幕府的命运。男女逆转的格局形成已达三十年之久，第五代将军纲吉（菅野美穗饰）坐镇幕府，指引着日本朝向未知的方向航行。大奥深宫，侧室传兵卫（要润饰）凭借将军之父桂昌院（西天敏行饰）的庇护和为将军生下独生女松姫的功劳而荣耀一时。与之对立的御台所信平（宫藤官九郎饰）深表不满，从京都找来兼具美貌与才华的公家落魄子弟右卫门佐（堺雅人饰），企图夺取将军的宠幸。右卫门佐机敏果敢，他的言行得到将军赏识，从此一跃成为执掌后宫大权的总取缔。此后的岁月里，为子嗣和政治心力交瘁的纲吉，以及在派系斗争中周旋往复的右卫门佐，彼此的命运深深扭结在一起……　　本片根据少女漫画家吉永富美原作改编。