塔克中尉（丹尼斯·奎德DennisQuaid饰）性格冲动，蔑视威权，但他同时是开发缩微飞行器技术的“阿尔法计划”的主驾驶员。塔克酒后胡作非为导致记者女友莉迪亚（梅格·瑞恩MegRyan饰）愤怒离去，当日的工作则同样遭遇了挫折——一群匪徒闯入研究中心，试图将研制中的缩微飞行器芯片夺走，研究员为了保住芯片，将已经进入缩微状态的塔克和飞行器注入了一名路人杰克（马丁·肖特MartinShort饰）的屁股，杰克是一名神经过敏的超市收银员，塔克在杰克的身体内部游走，帮助其躲过匪徒的追踪后返回研究中心求助，然而中心为利益决定放弃杰克体内的塔克，二人无奈只得自救，他们向莉迪亚求助，想要在塔克的氧气耗尽前夺回被抢走的芯片，令塔克恢复原来的大小……

影片根据迪士尼乐园游玩项目“丛林巡航”改编，故事发生在野心家与探险家并起的上世纪初，勇敢无畏的女科学家莉莉·霍顿博士（艾米莉·布朗特饰）来到亚马逊寻找有治愈魔力的神树，并雇佣了玩世不恭的弗兰克船长（道恩·强森饰）开启探险。在这史诗般的冒险途中，看似不对盘的两人在茂密雨林中遭遇了无数的危险和超自然力量。但随着这棵神奇古树的秘密逐渐揭开，莉莉和弗兰克的命运，乃至整个人类的命运都岌岌可危。

改编自欧美畅销图文书--詹姆斯-克里斯特森《voyageofthebasset》                                     古板的教授父亲和两个女儿，受到恶灵魔兽的攻击，逃难中搭上了独角兽之船，航行到神秘的仙境王国。仙境的精灵国王和皇后赋予教授一家人魔法神奇的力量，并托付一项重要的任务--寻找传说中智慧仁慈的统治者。                                     但是，可怕的恶灵魔兽正虎视眈眈想要征服精灵们的仙境，教授一家人被赋予保护这块土地的神圣任务。只有完成任务才可以回到原来世界，到底教授一家人能否捍卫仙境、安然度过这项危机呢？

故事背景设定在巴西的亚马逊丛林中，讲述了一群人克服重重险阻寻找“丛林之心”的故事。船长勒贝克接受了阿曼达兄妹和薇拉的包船请求，带领他们去寻找失踪的考古学家，也就是阿曼达的父亲内森。薇拉作为雇佣内森的公司代表，和兄妹俩之间有所介怀。两组人之间的紧张关系与他们面临的来自当地野生动物和神秘丛林神祇的威胁相比，显得微不足道。根据内森日记的内容，一行人前往传说中的“桑赛伊达”，找到了守护丛林的绿宝石“丛林之心”。最终，薇拉牺牲，父女三人逃脱了险境，同时告诫世人要对这片土地具有敬畏之心。电影的剧情充满了惊险和刺激，阿曼达和薇拉在丛林中遭遇了各种危险，包括毒箭蛙、食人鱼、巨蟒、蜘蛛，甚至是敌对的部落。《神秘奇航》是一部充满冒险和惊喜的电影，它展示了人类的勇气、决心和对未知的探索，同时也对生态破坏问题提出了警示。