本剧改编自手冢治虫的《新选组》，讲述了父亲被斩杀的丘十郎为了磨练剑术报仇加入了新选组。在入伍考试中认识了冷酷的少年大作。出身不明，剑手光一的大作作为期待的大型新人被引入新选组。2人虽然培养了火热的友情，但不知不觉被时代的波浪捉弄，进入了必须互相残杀的悲壮的命运。

幕末的德川幕府，因列强的压迫下，力量衰减，从此一蹶不振。就在此时，由芹泽鸭、近藤勇、土方岁三、山南敬助、冲田总司等人组织了“新选组”共同保卫幕府的政权。浪人山崎烝（市川雷藏饰），因被新选组局长近藤勇（城健三朗饰）的个人魅力所折服。不顾伴侣的强烈反对下，踌躇滿志的向新选组毛遂自荐，要求加入。随之山崎以他超群的剑法，很快的得到近藤和土方等人的信赖，而前局长芹泽鸭在新选组内部革命时遭到了处决，正好被山崎见状，从此对新选组有所顾忌，“池田屋事件”中，山崎为了保护的同伴，不得不举刀来对抗在池田屋的讨幕人士，事件之后他放弃了以前的伴侣，随着新选组扬长而去。

幕府后期，日本史上相当有人气的其中一个团体，一方面也是令勤王志士们闻风丧胆的年轻集团－新选组。以局长近藤勇为主轴，日本的未来就寄托在他们身上，是描述贯彻自己的信念的幕末青春物语。

1859年（安政六年），江户。土方岁三沉迷于挑战各大道场比武切磋。某日，土方造访了一个名为“试卫馆”的道场。这个道场的馆主，正是后来成为新选组局长的近藤勇。土方与近藤交战，却完败于近藤那压倒性的实力之下。为了超越这种强大，土方决定拜入试卫馆门下。数年后，近藤以及试卫馆的成员们以“护卫将军”为名，参加了新组建的浪士组，并作为其中一员前往京都。当时的京都，是一个聚集了来自全国各地、怀抱着各种背景与目的之人的异样都市。佐幕派、攘夷派、倒幕派混杂其中，暗杀、阴谋、政治博弈接连不断。此后，他们与芹泽鸭一派共同组成了以镇压活动中的攘夷派志士为目的的“壬生浪士组”。壬生浪士组由芹泽与近藤共同担任局长，土方、山南以及芹泽派的新见锦担任副长。但随着时间推移，试卫馆派与芹泽派的主导权之争愈演愈烈，双方不断发生冲突，局势日趋激烈。

幕末的江户，终日打架斗殴、被称作“刺头”的土方岁三，与近藤勇、山南敬助、冲田总司等人命运般相遇，在试卫馆第一次获得了如同“家人”般的羁绊。后来，他与在江户掀起血雨腥风的辻斩魔冈田以藏展开生死决斗，在刀光剑影中结下无可替代的友情，并约定日后再战。然而，当他们怀抱大志上洛之时，等待着他们的却是芹泽鸭压倒性的暴力与疯狂，以及同伴的背叛与死亡这一残酷现实。本剧改编自橋本エイジ和梅村真也的同名原著漫画。