随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——

Mac（黎明）、Bird（陈小春）、Sam（李灿森）和Michelle（雪儿）是国际神偷组织界的精英，四人一向合作无间配合默契，完成过许多艰巨任务。 此次四人要到马来西亚侦察一名科学家，希望偷取其刚研制成功的治癌药。可是在悄悄潜入药厂行动的过程中四人却遭遇埋伏，方知此次任务是骗局一场。在四人试图逃脱的过程中，Mac失手，但因神秘性感的女子June（舒淇）得以解困。从June身上，Mac忆起前女友被旧拍档出卖而死去的往事，并拥有了一个破解迷局的重要线索。

时光流转，一度繁荣的机器人技术走过辉煌、繁荣，继而迎来了问题多多的衰退时代。伴随着经济的走低，曾经荣耀一时的特车二课也仿佛进入了暮年，98式INGRAM毛病不断，随时需要检修，荣光的第一代成为历史，毫无个性的第二代被湮没在历史的尘埃中，第一小队解散后，第二小队在百无聊赖中等待着出任务的那一刻。而今后藤田（筧利夫饰）担任队长，麾下聚集了泉野明（真野惠里菜饰）、塩原佑马（福士诚治饰）、卡莎（太田莉菜饰）等一群个性满满的第三代成员。                                    　　他们每天维护、训练、执勤，兼带插科打诨，互相吐槽，慵懒无味的日常，记录下次世代警察们每一个超级无聊的瞬间……

在毫无征兆的一个晴朗日子，一枚导弹笔直飞来，将国际大都会东京都内极具代表性的彩虹桥炸为两截。该事件在都内引起不小的骚动，此后不久，警视厅公安部外事三课的警部高畑慧（高岛礼子饰）带着相关视频资料找到藤田继次（筧利夫饰）所统率的特车二课，经分析发现这次袭击来自于那架自卫队不久前失窃的新型战斗直升机AH-88J2改“灰色幽灵（GreyGhost）”。经高畑之口得知，该恐怖事件与拓植行人、灰原零（森カンナ饰）有直接的关系。而在纷乱的实践中，特车二课则面临着被撤消的危险。 　　东京一千万人口沦为暴动分子的人质，面对前所未有的危机，泉野明（真野惠里菜饰）和她的LABOR能否力挽狂澜？

世界观　　故事发生在时间和地点皆无法判明的超未来。　　世界由高度发达的网络（软件）和作为其现实载体的超构造体（硬件）所构成。本该是得益于科技繁荣发展的人类却由于一场灾难丧失了连接网络的资格和能力（相当于公民权）。　　没有了支配者的AI依据管理规定开始排斥失去了网络连接资格的人类。而忘却了曾经的繁荣的人们，只能在管理系统的阴影下苟且偷生。本作的舞台就被设定在这样一个人类日渐衰亡的世界。　　都市构造体　　作为舞台的世界就像一个巨大的高楼或者说是连接了所有建筑的巨大都市。大部分为超构造体所遮蔽，形成了阶梯结构。由于建设者的失控，都市构造体正在无止境地扩大之中，就本作故事发生的时间为止至少已抵达木星轨道面。根据统治局描述，正是都市的这样漫无目的地成长从根本上导致了波及全世界的混乱。其结果毋庸置疑的人口密度极度下降。　　环境　　就都市构造体所涉及的范畴由于其间散布的纳米机器人的作用保证了生物学上的病毒的排除实现了无菌状态。而这一成果则是由曾经机能正常运转时候的网络球给予统治局的指示所实现的。同一作者的《BIOMEGA》和《DEADHEADS》作品主体中的由于强力病毒引发的传染病在本作中原则上是不可能发生的。从这些设定中可以推断作为网络終端遗传因子的变异原因的“感染”不等同于其字面上的感染，很有可能是由于系统逻辑上的分歧所引起的。　　故事大纲　　探索者雾亥流浪在数千层无边无际的巨大阶梯都市之中。手持可以贯穿一切物质的重力子放射线射出装置追寻着网络終端遗传因子。