日本。在伊豆海岸航行的一艘赌船上，铁龙会会长遭到年轻保镖石川五右卫门的袭击，石川五右卫门救了他。然而，紧接着发生了巨大的爆炸，船被毁了。老板也失去了生命。爆炸的起因是一名使用斧头作为武器的大汉。五右卫门曾一度将这名男子逼入绝境，但他成功逃脱。与此同时，成功从赌船上偷钱的鲁邦三世、次元大辅和峰不二子在海上的船上目睹了这一事件。《百慕大之魂》——这就是所谓的大人物。一名代号为霍克的士兵，曾在战场上杀死了2000人。为什么日本的公安督察钱形会追随霍克的脚步？在老板的葬礼上被贴上叛徒标签的五右卫门追赶霍克以报耻辱。

石川五右卫门是活跃在安土桃山时代的日本劫富济贫的大盗，专门和丰臣秀吉对着干。由于是以石川五右卫门为正面角色进行戏说演绎，本剧将丰臣秀吉设定为了实施暴政的反派boss并对历史做出了一定修改

16世纪末的日本，明智光秀发动本能寺之变，杀害了离称霸天下只有一步之遥的织田信长，丰臣秀吉（奥田瑛二饰）率兵打败光秀，继而建立丰臣政权，天下得到久违的和平。　　15年后的和平年代，劫富济贫的大盗石川五右卫门（江口洋介饰）名扬四海，备受穷苦老百姓的喜爱。盛典之夜，五右卫门潜入某富豪家中行窃，结果导致该富豪及其家人被五奉行之一的石田三成杀害。原来五右卫门顺手牵羊偷走了一个藏有惊天秘密的匣子，随后又将其扔掉。次日，得知昨夜详情的五右卫门来到贫民窟寻找匣子，与此同时，石田三成也派出忍者雾隐才藏（大泽隆夫饰）追踪匣子的下落。连番激烈的搏斗旋即展开，而那个惹来腥风血雨的匣子究竟有隐藏着什么秘密呢？