人類の中に“第七波動（セブンス）”と呼ばれる特殊能力を持つ者――第七波動（セブンス）能力者が現れ始めた近未来。世界中が混乱をきたす中、日本国内では、巨大複合企業“皇神（スメラギ）”グループの統制により安定した秩序が保たれていた。……しかし、皇神がもたらした平和とは、能力者の犠牲の上に成り立つ仮初めの平和に過ぎなかった。表向きにはクリーンな企業として振舞いながらも、その裏では能力者たちを強制収容し、非人道的な人体実験を今なお続ける皇神。そんな皇神の裏にいち早く気付き、反旗を翻した組織があった――その名を“フェザー”。フェザーに所属する第七波動（セブンス）能力者の少年“ガンヴォルト”は、能力者たちの自由のため、今夜もまた皇神の施設へと潜入するのだった。
故事发生在二十一世纪初叶，全球气候持续变暖，融化的冰山淹没了大部分陆地，与此同时，名为“雾之舰队”的战舰群从天而降占领了海域，人类的生存空间逐渐遭到蚕食。千早群像（兴津和幸配音）是一名士官候补生，某日，一艘名为“伊401”的潜水艇出现在了她的面前。就这样，群像成为了潜水艇的驾驶员。皮肤黝黑大大咧咧的橿原杏平（宫下荣治配音）、温婉可人足智多谋的八月一日静香（东山奈央配音）、带着面具十分神秘的织部僧（松本忍配音），活泼可爱身手敏捷的四月一日伊织（津田美波配音），一群怀抱着拯救人类之重大理想的战友们聚集到了潜水艇之中，为了夺回本该属于人类的领地和敌人展开了激烈的战斗。
