《魍魉之匣》改编自京极夏彦百鬼夜行系列的第二部作品。榎木津礼二郎（阿部宽饰）经营侦探事务所。一天，原电影明星柚木阳子（黑木瞳饰）委托其受理她14岁的女儿加菜子（寺岛咲饰）失踪一案。作家关口巽（椎名桔平饰）和记者鸟口守彦（Magy饰）对最近发生的美少女被肢解杀人事件十分好奇，一起前往现场追查，却在路途中迷路而误入一栋奇怪的盒状建筑物。负责侦破连续杀人事件的青木警官（堀部圭亮饰）乘坐的列车上加菜子被撞下车送往医院。刑警木场修（宫迫博之饰）强忍疲惫下接手处理案件，却发现加菜子的母亲，正是他暗恋多年的阳子。但日，运送加菜子的救护车和随同车辆消失在了匣馆的领地中。消失的少女、相模湖分尸杀人案、追查案件的木场和关口、盒子般奇怪的建筑物，到底是什么将他们联系在一起？魍魉，真的只存在人心吗？
2007年，德克萨斯州弗雷斯诺。拉斐尔(19岁)因涂鸦被捕，被关进县监狱。他是个好孩子。那只是涂鸦而已。所以你不能将他被捕后发生的事件归咎于拉斐尔。他不应对诱捕行动、自杀、Flophouse的新混音带、威廉姆斯警官和她的妄想、冰毒管道、联邦调查局、一无所有的富家子弟、马特奥、猪拉里、所有的刀、当地有抱负的电视女新闻工作者、失败的钚交易或任何可能因交易失败而死亡的人负责。这些都不是拉斐尔的错，但却是他的问题。拉斐尔走出牢房的那一刻，他就会陷入这场混乱的过山车之旅中。这是一个游乐设施，只要你不是其中一员，观看它的运转就会是一种乐趣。
